С августа 2005 года футболист провел за национальную команду 89 матчей и забил 6 мячей.
Полузащитник «Трабзонспора» Джон Оби Микел объявил о завершении выступлений за сборную Нигерии, в составе которой он дебютировал в 18-летнем возрасте. Сейчас Оби Микелу 32, и за время профессиональной карьеры он успел поиграть в таких клубах, как норвежский «Люн», английские «Челси» и «Мидлсборо», а также китайский «Тяньцзинь Тэда».
С 1 июля этого года нигериец является игроком «Трабзонспора».