Большую часть своей карьеры 26-летний Бакдаулет провел в шымкентском «Ордабасы», за основную команду которых провел 124 матча. Также в карьере защитника значатся 18 матчей за павлодарский «Иртыш».
Летом прошлого года Кожабаев перешел в «Кызыл-Жар СК» и сыграл 9 матчей.